ESHG2021会议速递|药物基因组学如何能更好地帮助临床患者进行诊疗?
2021-09-06

ESHG2021|药物基因组学如何能更好地帮助临床患者进行诊疗?


ESHG2021

第65届欧洲人类遗传学年会


会议时间

2021年8月28-31日


会议简介

欧洲人类遗传协会成立于1967年,是一个非营利性国际组织,让与会者有机会与知名专家、专业人员讨论遗传学的最新进展,旨在促进人类医学遗传学基础和应用研究,并促进该领域研究人员之间的联系协作


赛福追踪报道

赛福基因团队邀请了德国美因茨大学医学遗传系临床遗传医生丁灿博士,这几天会持续给大家带来会议的重要内容。


往期会议推文

《80%欧洲遗传咨询师的经验:当产前诊断遇到VUS怎么办?》

当NIPT遇到“假警报”和“意外发现”时该如何处理?》

ESHG2021会议速递|一文读懂:基因检测结果对癫痫治疗的影响到底有多大?》




# 药物基因型在临床上的应用 #


最近几年,随着学界对药物基因组学的理解加深,药物基因型在临床上的应用也越来越多。




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荷兰Leiden大学的Svwn教授介绍了荷兰药物基因组学工作组DPWG数十年来建立临床应用共识的努力。

目前这个共识已经在欧洲范围内得到了广泛的认可,从2020年开始,这些共识作为一个DPWG指南系列,陆续更新后发表在EJHG期刊上。需要的读者可以参考本文末尾的文献。


当临床医生遇到一位具体的病人,怎么确定这位病人需要药物基因组分析呢?DPWG设计了一个评分表Clinical Implication Score(参考文献1),帮助医师们快速评估患者是否需要基因型分析。


最后的分值在6以上的,必须在用药之前做基因组分型;分值在3到5之间的,也应当考虑基因组分型。


通过十多年的努力,DPWG工作组已经积累了关于103个基因以及相关药物的知识,整合在临床医生使用的病例管理系统中。


以Leiden大学的病例管理系统为例,医生为某一位病人开处方,如果这个药物在系统中有记录,与基因组学相关,那么系统就会自动提示医生相关基因的信息,并且检索这个病人是否已经有了基因型检查的结果。他们希望,未来这个系统能够推广到大学医院以外的、更多的医院之中,为广大的医师和患者提供方便。


英国的William Newman教授从“可及性”这个角度进行了剖析。


Newman教授介绍英国已经规定在使用卡马西平、硫唑嘌呤这些药物之前,必须对病人进行相应的基因型分析,确定药物的合适剂量。


那么,在医院的实际操作中,这样的操作能够实现么?他将实验室划分成四个不同的层次,最高级别的是四级的国家实验室级别,方便把所有样本集中进行测序分析。然后是区域性的三级实验室。再下一层是当地医院的实验室。最基础的分析,他称之为一级/基础级别Point of Care TestPoCT,只要有需要,可以在任何地点进行分析。糖尿病人监测血糖,现在COVID流行期间的快速病毒抗原检测都是很好的例子。


Newman教授强调,有好几种药物,需要比较方便地,快速地对病人进行基因型分析。


比如,一家加拿大公司提供了一种非常方便的仪器,可以在氯吡格雷用药之前进行患者基因分型。



另一个例子是华法林。有几种基因变异会导致使用华法林之后的出血风险。也有一家公司尝试开发快速测试仪器,可惜这个仪器到目前为止并没有获得较大的成功。


Newman教授介绍了他将基因型分析用于儿科ICU患者的经验。大约每500人中就有一个个体携带有m1555A>G突变,这些个体接受庆大霉素治疗后有耳聋风险。而儿科ICU的严重感染中,需要使用庆大霉素控制感染的情况又比较紧急。从世界范围来看,每年有大约七百万新生儿接受庆大霉素治疗。



Newman教授与同事合作,协助开发了一款掌上仪器,可以在25分钟之内得到m1555基因位点的信息,方便医师鉴别出有耳聋风险的新生儿,及时改变用药方案。





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Vita Dolzan 教授以具体的病例,

讲述了药物基因组学如何帮助病人。

第一位病人是35岁的乳腺癌肿瘤病人。在使用5-fluorouracil(氟尿嘧啶),epirubicin(表阿霉素),cyclophosphamide(环磷酰胺)联合化疗之后,她出现了非常严重的副反应,住院治疗了10天。


目前在药物基因组知识库中,我们已经知道DPYD基因型会影响病人对5-FU的反应。对这位病人的分析也显示,病人携带c.1678T>G 和c.2846A>T 变异,5-FU治疗会导致严重的副反应。



--欧洲药监局建议,在使用fluorouracil(氟尿嘧啶),capecitabine(卡培他滨),tegafur(喃氟啶)和flucztosine之前,需要进行DPYD基因型分析或者酶代谢分析。


第二个病例是58岁的抑郁症患者。在使用paroxetine(帕罗西汀)21天之后,由于严重的副作用,患者自行停药了。之后他换用了citalopram(西酞普兰)。两周后他出现了焦虑、麻痹的感觉,因而换用sertraline(舍曲林)。两三周后他再次感到难以忍受的副作用。最终,换成duloxetine(度洛西汀)和vortiozxetine(沃替西汀)后,副作用变得不太严重,患者可以坚持用药。


现在我们已经知道,CYP2D6和CYP2C19基因型影响抗抑郁药的代谢。



对患者进行基因型分析之后,发现之前使用的三种药物都不适合患者的基因型。而最终选择的两种药物duloxetine度洛西汀和vortioxetine沃替西汀才是适合这位患者的。



第三个例子是一位患多种慢性病的58岁女性。



因为既往药物副作用的不良体验,即使现在患者的动脉硬化需要治疗,她也比较抗拒。拿到药物基因组学测试结果后,医生和患者解释,针对她SLCO1B1的基因型,DPWG工作组是推荐使用调整剂量的statin治疗方案的。这样,患者终于同意接受斯汀药物的降脂治疗。



这个病例中,个体化的测试结果,对说服患者起到了很重要的作用。





参考文献



  1. Pharmacogenetic Information in Clinical Guidelines: The European Perspective,Clin Pharmacol Ther. 2018 May;103(5):795-801

  2. Dutch Pharmacogenetics Working Group (DPWG) guideline  for the gene–drug interaction of DPYD and fluoropyrimidines,European Journal of Human Genetics 
     28, 508–517 (2020)

  3. Dutch Pharmacogenetics Working Group (DPWG) guideline for the gene–drug interaction between CYP2D6 and opioids (codeine, tramadol and oxycodone), European Journal of Human Genetics (2021)




更多指南参见



www.pharmagkb.org



丁灿博士简介
丁灿博士主要研究方向为神经基因方向。毕业于同济医学院,随后在德国柏林自由大学Charite医学院以及巴黎UPMC大学进行神经肌病基因诊断与治疗方面的研究。在欧洲遗传学实验室工作多年。现任欧洲人类遗传学学会教育委员会青年委员。